Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms