Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PCGF6Q9BYE7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms