Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms