Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms