Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms