Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms