Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CTTNBP2Q8WZ74 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CTTNBP2Q8WZ74 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CTTNBP2Q8WZ74 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CTTNBP2Q8WZ74 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CTTNBP2Q8WZ74 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CTTNBP2Q8WZ74 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CTTNBP2Q8WZ74 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CTTNBP2Q8WZ74 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
CTTNBP2Q8WZ74 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CTTNBP2Q8WZ74 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CTTNBP2Q8WZ74 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CTTNBP2Q8WZ74 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CTTNBP2Q8WZ74 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CTTNBP2Q8WZ74 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
CTTNBP2Q8WZ74 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CTTNBP2Q8WZ74 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms