Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms