Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC24Q8N4L8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms