Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
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