Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPBP1Q86WP2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms