Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NLRX1Q86UT6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms