Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms