Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms