Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS54

PSMG4, Proteasome assembly chaperone 4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG4Q5JS54 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMG4Q5JS54 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMG4Q5JS54 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMG4Q5JS54 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMG4Q5JS54 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMG4Q5JS54 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMG4Q5JS54 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMG4Q5JS54 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms