Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms