Protein–RNA interactions for Protein: Q52M75

LINC01554, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01554, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01554Q52M75 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01554Q52M75 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms