Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms