Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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