Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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