Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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