Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms