Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms