Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms