Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms