Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms