Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms