Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
CLIP1P30622 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLIP1P30622 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms