Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL2P19875 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL2P19875 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms