Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHGAP10645 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHGAP10645 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHGAP10645 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHGAP10645 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHGAP10645 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHGAP10645 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHGAP10645 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHGAP10645 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHGAP10645 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CHGAP10645 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHGAP10645 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHGAP10645 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHGAP10645 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHGAP10645 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHGAP10645 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHGAP10645 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHGAP10645 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHGAP10645 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHGAP10645 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHGAP10645 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHGAP10645 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHGAP10645 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CHGAP10645 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHGAP10645 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CHGAP10645 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CHGAP10645 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CHGAP10645 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CHGAP10645 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CHGAP10645 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CHGAP10645 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHGAP10645 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHGAP10645 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHGAP10645 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CHGAP10645 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHGAP10645 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHGAP10645 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHGAP10645 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHGAP10645 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHGAP10645 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHGAP10645 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CHGAP10645 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHGAP10645 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHGAP10645 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHGAP10645 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHGAP10645 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHGAP10645 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHGAP10645 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHGAP10645 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHGAP10645 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHGAP10645 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHGAP10645 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHGAP10645 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHGAP10645 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHGAP10645 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHGAP10645 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHGAP10645 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHGAP10645 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHGAP10645 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHGAP10645 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHGAP10645 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHGAP10645 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHGAP10645 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHGAP10645 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHGAP10645 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHGAP10645 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHGAP10645 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHGAP10645 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CHGAP10645 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHGAP10645 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHGAP10645 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHGAP10645 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHGAP10645 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHGAP10645 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHGAP10645 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CHGAP10645 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHGAP10645 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHGAP10645 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHGAP10645 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CHGAP10645 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHGAP10645 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHGAP10645 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHGAP10645 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHGAP10645 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHGAP10645 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHGAP10645 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHGAP10645 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHGAP10645 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CHGAP10645 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHGAP10645 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHGAP10645 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CHGAP10645 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHGAP10645 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHGAP10645 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHGAP10645 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHGAP10645 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHGAP10645 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHGAP10645 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHGAP10645 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHGAP10645 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms