Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms