Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD1P0DJD0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms