Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOA1P02647 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOA1P02647 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOA1P02647 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOA1P02647 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOA1P02647 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOA1P02647 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOA1P02647 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOA1P02647 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOA1P02647 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOA1P02647 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOA1P02647 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOA1P02647 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOA1P02647 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOA1P02647 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOA1P02647 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOA1P02647 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOA1P02647 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOA1P02647 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA1P02647 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA1P02647 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA1P02647 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA1P02647 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA1P02647 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA1P02647 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA1P02647 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA1P02647 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA1P02647 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA1P02647 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA1P02647 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA1P02647 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA1P02647 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA1P02647 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA1P02647 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA1P02647 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms