Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM2O94769 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM2O94769 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM2O94769 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM2O94769 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM2O94769 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM2O94769 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ECM2O94769 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM2O94769 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM2O94769 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM2O94769 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM2O94769 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM2O94769 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM2O94769 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM2O94769 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM2O94769 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM2O94769 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM2O94769 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM2O94769 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM2O94769 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM2O94769 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM2O94769 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM2O94769 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM2O94769 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM2O94769 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM2O94769 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM2O94769 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM2O94769 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM2O94769 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM2O94769 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM2O94769 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM2O94769 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM2O94769 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM2O94769 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM2O94769 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ECM2O94769 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM2O94769 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM2O94769 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM2O94769 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM2O94769 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM2O94769 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM2O94769 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM2O94769 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM2O94769 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM2O94769 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM2O94769 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM2O94769 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM2O94769 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM2O94769 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM2O94769 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM2O94769 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM2O94769 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM2O94769 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM2O94769 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM2O94769 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM2O94769 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM2O94769 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM2O94769 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM2O94769 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM2O94769 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM2O94769 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms