Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP5O75197 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP5O75197 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP5O75197 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP5O75197 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP5O75197 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP5O75197 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP5O75197 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP5O75197 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP5O75197 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP5O75197 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP5O75197 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP5O75197 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP5O75197 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP5O75197 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP5O75197 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP5O75197 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP5O75197 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP5O75197 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP5O75197 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP5O75197 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP5O75197 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP5O75197 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP5O75197 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP5O75197 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP5O75197 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP5O75197 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP5O75197 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP5O75197 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP5O75197 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP5O75197 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP5O75197 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP5O75197 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP5O75197 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP5O75197 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRP5O75197 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRP5O75197 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRP5O75197 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRP5O75197 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRP5O75197 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRP5O75197 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRP5O75197 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRP5O75197 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP5O75197 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP5O75197 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP5O75197 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP5O75197 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP5O75197 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP5O75197 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP5O75197 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP5O75197 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP5O75197 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP5O75197 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP5O75197 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP5O75197 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP5O75197 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP5O75197 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP5O75197 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP5O75197 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP5O75197 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP5O75197 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP5O75197 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP5O75197 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP5O75197 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP5O75197 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP5O75197 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP5O75197 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP5O75197 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP5O75197 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP5O75197 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP5O75197 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP5O75197 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP5O75197 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP5O75197 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP5O75197 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP5O75197 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP5O75197 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP5O75197 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP5O75197 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP5O75197 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP5O75197 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP5O75197 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP5O75197 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP5O75197 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP5O75197 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP5O75197 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP5O75197 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP5O75197 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP5O75197 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP5O75197 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP5O75197 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP5O75197 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP5O75197 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP5O75197 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP5O75197 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP5O75197 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP5O75197 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP5O75197 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP5O75197 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP5O75197 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms