Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRXO43186 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRXO43186 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRXO43186 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRXO43186 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRXO43186 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRXO43186 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRXO43186 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRXO43186 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRXO43186 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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