Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBDO15205 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBDO15205 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBDO15205 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBDO15205 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBDO15205 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBDO15205 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBDO15205 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBDO15205 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBDO15205 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBDO15205 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBDO15205 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBDO15205 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBDO15205 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBDO15205 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBDO15205 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBDO15205 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBDO15205 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBDO15205 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBDO15205 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBDO15205 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBDO15205 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBDO15205 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBDO15205 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms