Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIP1O00291 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIP1O00291 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIP1O00291 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIP1O00291 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIP1O00291 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIP1O00291 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIP1O00291 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIP1O00291 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIP1O00291 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HIP1O00291 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIP1O00291 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIP1O00291 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIP1O00291 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIP1O00291 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HIP1O00291 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIP1O00291 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIP1O00291 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIP1O00291 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIP1O00291 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIP1O00291 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIP1O00291 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIP1O00291 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIP1O00291 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIP1O00291 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIP1O00291 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIP1O00291 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIP1O00291 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIP1O00291 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HIP1O00291 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIP1O00291 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIP1O00291 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIP1O00291 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIP1O00291 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIP1O00291 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIP1O00291 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIP1O00291 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIP1O00291 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIP1O00291 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIP1O00291 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIP1O00291 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIP1O00291 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIP1O00291 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HIP1O00291 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIP1O00291 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIP1O00291 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HIP1O00291 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIP1O00291 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIP1O00291 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIP1O00291 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIP1O00291 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HIP1O00291 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIP1O00291 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIP1O00291 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIP1O00291 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIP1O00291 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIP1O00291 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIP1O00291 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIP1O00291 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIP1O00291 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIP1O00291 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIP1O00291 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIP1O00291 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIP1O00291 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIP1O00291 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HIP1O00291 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HIP1O00291 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIP1O00291 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIP1O00291 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIP1O00291 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIP1O00291 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIP1O00291 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HIP1O00291 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIP1O00291 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms