Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQV1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQV1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQV1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQV1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQV1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQV1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQV1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQV1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQV1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQV1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQV1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQV1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQV1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQV1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQV1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQV1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
H3BQV1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQV1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQV1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQV1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQV1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQV1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQV1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQV1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQV1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQV1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQV1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQV1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQV1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQV1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQV1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQV1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQV1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQV1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQV1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQV1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQV1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQV1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQV1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQV1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQV1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQV1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQV1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQV1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQV1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQV1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQV1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQV1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQV1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQV1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQV1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQV1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQV1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQV1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQV1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms