Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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