Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms