Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF222A6NCQ9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF222A6NCQ9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms