Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms