Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP20Q9Y6A4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP20Q9Y6A4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP20Q9Y6A4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP20Q9Y6A4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP20Q9Y6A4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP20Q9Y6A4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP20Q9Y6A4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP20Q9Y6A4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP20Q9Y6A4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP20Q9Y6A4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP20Q9Y6A4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP20Q9Y6A4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP20Q9Y6A4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP20Q9Y6A4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP20Q9Y6A4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms