Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NUBP2Q9Y5Y2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUBP2Q9Y5Y2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUBP2Q9Y5Y2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUBP2Q9Y5Y2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms