Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM9Q9Y5J7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM9Q9Y5J7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TIMM9Q9Y5J7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM9Q9Y5J7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM9Q9Y5J7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM9Q9Y5J7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM9Q9Y5J7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM9Q9Y5J7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM9Q9Y5J7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM9Q9Y5J7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM9Q9Y5J7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM9Q9Y5J7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM9Q9Y5J7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM9Q9Y5J7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM9Q9Y5J7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM9Q9Y5J7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM9Q9Y5J7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms