Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMED5Q9Y3A6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMED5Q9Y3A6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMED5Q9Y3A6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMED5Q9Y3A6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMED5Q9Y3A6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMED5Q9Y3A6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMED5Q9Y3A6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMED5Q9Y3A6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMED5Q9Y3A6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMED5Q9Y3A6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMED5Q9Y3A6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMED5Q9Y3A6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMED5Q9Y3A6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMED5Q9Y3A6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMED5Q9Y3A6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMED5Q9Y3A6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMED5Q9Y3A6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMED5Q9Y3A6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMED5Q9Y3A6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms