Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A4

RRP7A, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7AQ9Y3A4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RRP7AQ9Y3A4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
RRP7AQ9Y3A4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RRP7AQ9Y3A4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
RRP7AQ9Y3A4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRP7AQ9Y3A4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRP7AQ9Y3A4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RRP7AQ9Y3A4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RRP7AQ9Y3A4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RRP7AQ9Y3A4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RRP7AQ9Y3A4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
RRP7AQ9Y3A4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
RRP7AQ9Y3A4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RRP7AQ9Y3A4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RRP7AQ9Y3A4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RRP7AQ9Y3A4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRP7AQ9Y3A4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRP7AQ9Y3A4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRP7AQ9Y3A4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRP7AQ9Y3A4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRP7AQ9Y3A4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RRP7AQ9Y3A4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRP7AQ9Y3A4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RRP7AQ9Y3A4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RRP7AQ9Y3A4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RRP7AQ9Y3A4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RRP7AQ9Y3A4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RRP7AQ9Y3A4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRP7AQ9Y3A4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRP7AQ9Y3A4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRP7AQ9Y3A4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RRP7AQ9Y3A4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
RRP7AQ9Y3A4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RRP7AQ9Y3A4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RRP7AQ9Y3A4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RRP7AQ9Y3A4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
RRP7AQ9Y3A4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RRP7AQ9Y3A4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RRP7AQ9Y3A4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RRP7AQ9Y3A4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RRP7AQ9Y3A4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RRP7AQ9Y3A4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RRP7AQ9Y3A4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RRP7AQ9Y3A4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
RRP7AQ9Y3A4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RRP7AQ9Y3A4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRP7AQ9Y3A4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RRP7AQ9Y3A4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RRP7AQ9Y3A4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RRP7AQ9Y3A4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RRP7AQ9Y3A4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RRP7AQ9Y3A4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RRP7AQ9Y3A4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RRP7AQ9Y3A4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RRP7AQ9Y3A4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RRP7AQ9Y3A4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RRP7AQ9Y3A4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RRP7AQ9Y3A4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms