Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPR55Q9Y2T6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPR55Q9Y2T6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPR55Q9Y2T6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPR55Q9Y2T6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPR55Q9Y2T6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPR55Q9Y2T6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPR55Q9Y2T6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPR55Q9Y2T6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPR55Q9Y2T6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPR55Q9Y2T6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPR55Q9Y2T6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPR55Q9Y2T6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPR55Q9Y2T6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPR55Q9Y2T6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPR55Q9Y2T6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPR55Q9Y2T6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPR55Q9Y2T6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPR55Q9Y2T6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPR55Q9Y2T6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPR55Q9Y2T6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPR55Q9Y2T6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPR55Q9Y2T6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPR55Q9Y2T6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPR55Q9Y2T6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPR55Q9Y2T6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPR55Q9Y2T6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPR55Q9Y2T6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR55Q9Y2T6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR55Q9Y2T6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR55Q9Y2T6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR55Q9Y2T6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR55Q9Y2T6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR55Q9Y2T6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms