Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPH3AQ9Y2J0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPH3AQ9Y2J0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPH3AQ9Y2J0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPH3AQ9Y2J0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms